La pel·lícula ens trasllada deu anys després de la primera batalla de Pandora entre els Na'vi i els humans. 

En Jake Sully (Sam Worthington) viu tranquil·lament amb la seva família i la seva tribu. Ell i Ney'tiri han format una família i fan tot el possible per romandre junts, però es veuen obligats a abandonar la seva llar i explorar diferents i inhospitades regions de Pandora, endinsant-se al mar, fent pactes amb altres Na'vi i veient-se involucrats en una nova guerra contra els humans al resorgir una antiga amenaça.