Torna l'entremaliat i aventurer Peter Rabbit juntament amb la resta dels seus companys animals. En aquest segon lliurament, Bea i Thomas McGregor s'han casat. Encara que Peter Rabbit i Thomas abans eren autèntics enemics, ara s'han fet molt amics.

Això sí, malgrat haver aconseguit crear una família improvisada, el rebel conill tindrà les seves diferències amb McGregor i continuarà causant problemes. Per això, decidirà marxar sol, més enllà del jardí on sempre ha viscut.