Desesperat per demostrar que és una gran persona, Bob Esponja decideix demostrar la seva valentia davant el senyor Cranc seguint l'Holandès Errant, el misteriós llegendari pirata fantasma. Així comença una aventura marítima que el porta a les profunditats més remotes de l'oceà, on cap esponja no ha arribat mai.

1943. Franco ha bloquejat el pas de refugiats que fugen de la repressió nazi pels Pirineus. En la duana d'un poble fronterer, Manel Grau, un funcionari amb passat republicà, decideix contravenir les ordres ajudat per Juliana, una veïna del poble, i Jerôme, un passador francès. Entre tots inicien una croada per a ajudar a fugir de la guerra a tanta gent com sigui possible.

És llavors quan Manel es veurà atrapat en una perillosa odissea que despertarà en ell i en la seva dona Mercè vells fantasmes de l'encara recent guerra civil espanyola.